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Recent Submissions

  • Item type:Item,
    The EPPO/OLAF compendium of national procedures: Lithuania
    (2026) Hauck, Pierre; Schneider, Jan-Martin; Karakocaoğlu, Nur Sena; Laird, Alastair Alexander
    This Lithuanian EPPO/OLAF volume covers the procedures of the European Public Prosecutor's Office (EPPO) in Lithuania, including EU fraud typologies and relevant case law. The volume also contains information and provisions for defence lawyers working against the EPPO in cases of customs, financial, tax, or subsidy fraud. The second part is a guide to OLAF investigations in Lithuania, focusing on information controls and the relationship between national partners and external investigations. An anonymous person has acted as the publication’s national expert.
  • Item type:Item,
    The EPPO/OLAF compendium of national procedures: Slovakia
    (2026) Hauck, Pierre; Schneider, Jan-Martin; Karakocaoğlu, Nur Sena; Meyer, Sophie; Laird, Alastair Alexander
    This Slovakian EPPO/OLAF volume contains the relevant legislation, EU law and Slovak law, as well as the measures taken by the regional offices of the European Public Prosecutor's Office (EPPO) in criminal investigations into EU fraud offences. In addition, possible measures of the EPPO in Slovakia and EU fraud typologies are discussed. The second part of the volume deals with the investigative missions of the European Anti-Fraud Office (OLAF) in Slovakia, including the Slovak national scenery and the AFCOS structure. Prof Dr Libor Klimek has acted as the publication’s national expert.
  • Item type:Item,
    Preclinical studies on susceptibility to viral infection driving lung injury and disruptions to lung development in neonates with bronchopulmonary dysplasia
    (2025) Gunjak, Miša
    Bronchopulmonary dysplasia (BPD) is the most common complication of preterm birth, with significant morbidity and mortality, and is experimentally modelled by exposure of newborn mice to hyperoxia to mimic oxygen supplementation of preterm infants. Infants with BPD have a higher risk of acquiring a respiratory virus infection and have a worse disease course. The pathophysiological mechanisms underlying this increased risk of infection and more severe pathology have not been clarified, but include oxygen creating a more permissive environment for virus infection, or oxygen modulating the lung inflammatory response to virus infection. When neonatal mice were exposed to hyperoxia (85% O2) from birth, and then challenged with pneumonia virus of mice (PVM) on postnatal day (P)4, all hyperoxia-exposed pups infected at a 1:1,000 dilution of viral stock exhibited 100% mortality by P12. In contrast, mice maintained in room air survive PVM infection over a range of virus doses (1,1000, 1:2,500, or 1:5,000), highlighting a stark, dose-dependent synergy between oxygen toxicity and viral challenge. By P11, lungs from hyperoxia-exposed mice, with or without PVM infection, exhibit pronounced alveolar simplification, with enlarged airspaces and diminished septation. The PVM infection under conditions of hyperoxia provokes marked inflammatory infiltration, whereas lungs infected under conditions of normoxia (21% O2) retain normal architecture. Whole-body plethysmography revealed a dose-dependent decline in tidal volume, expiratory volume, minute volume, and breathing frequency in hyperoxia-infected mice. Despite identical early viral replication across both oxygen conditions, the addition of hyperoxia before and concomitant with virus infection reshapes inflammatory signaling and tissue remodeling. Gene expression in lung homogenates indicated early increases of Ccl2, Cxcl10, and Ccl3 mRNA transcript abundance under hyperoxia. Antibody microarrays revealed a shift from homeostatic chemokines (CCL2, IL-25) to pro-inflammatory and fibrotic mediators (IL-6, IL-8, TGF-β1-3) upon infection, with prior and concomitant hyperoxia magnifying CCL17, IL-15, and lung fibrosis pathways. Immune cell profiling using single-cell RNA sequencing revealed that hyperoxia depleted tissue-resident alveolar macrophages (TR-AM) and expanded exudate macrophages, dendritic cells, and neutrophils. Under normoxia, PVM infection enriches a virus-responsive TR-AM subset (AM_PVM), while hyperoxia completely eliminates these protective responses. Single-cell transcriptomics confirmed the loss of AM_HYX (a stress-adapted macrophage subset) and AM_PVM cells in hyperoxia-infected mice, with extensive dendritic cell expansion. Intranasal clodronate liposome–mediated TR-AM depletion in normoxia-treated, virus-infected animals mimicked the lethal phenotype noted in hyperoxia-infected animals, with 100% mortality by P15. These mice exhibited excessive lung inflammation, impaired respiratory function, and a hyperoxia-like proteomic signature, even as viral loads reduced. Therefore, TR-AM dysfunction and skewed inflammatory chemokine signaling, and not viral load, were associated with fatal outcome. Together, these findings reveal that hyperoxia disrupts macrophage-mediated immune regulation in the newborn mouse lung, converting a balanced antiviral defense into maladaptive inflammation. Strategies to preserve or restore TR-AM function may therefore protect preterm infants from severe respiratory viral disease. These novel findings might explain the predisposition of BPD patients to a high risk of respiratory virus infection and worse clinical outcomes.
  • Item type:Item,
    Analyse des Einflusses von seltenen Codons auf das „Ribosome Pausing“ und die Effizienz der Translation und Replikation des Hepatitis C Virus
    (2025) Hess, Carolin Sophie
    Das Hepatitis C Virus zählt zu den humanpathogenen Viren mit einzelsträngigen RNA-Genomen mit positiver Polarität. Es befällt vorwiegend Leberzellen und verursacht bei knapp 70 % der Betroffenen eine chronische Hepatitis C. Trotz der Verfügbarkeit hochwirksamer antiviraler Medikamente wird der Behandlungserfolg durch die oftmals späte Diagnosestellung und den begrenzten Medikamentenzugang limitiert. Unbehandelt führt die chronische Hepatitis C im Verlauf einiger Jahre zu einer Leberzirrhose, die mit einem erhöhten Risiko für ein hepatozelluläres Karzinom einhergeht, das in vielen Fällen nicht mehr kurativ therapiert werden kann. Ein Impfstoff wurde bislang nicht entwickelt. Obwohl HCV-Infektionen bis heute ein weltweites Gesundheitsproblem darstellen, ist über den molekularen Ablauf der Translation und Replikation sowie den Wechsel zwischen beiden Prozessen bis heute vieles nicht bekannt. Es bedarf daher weiterer Forschung zur Aufschlüsselung des viralen Replikationszyklus. In vorausgegangenen Studien von G. Gerresheim wurden zwei pausierende Ribosomen auf und vor dem NS5B-Stoppcodon sowie eine Häufung von konservierten, ineffizienten Codons in der NS5B codierenden Region vor dem Stoppcodon detektiert. Im Rahmen dieser Arbeit sollte analysiert werden, ob die ineffizienten Codons eine funktionelle Bedeutung in der Translation oder Replikation des HCV haben. Dazu wurden verschiedene subgenomische HCV-Replikons entwickelt, bei denen die ineffizienten Codons still, d. h. ohne Veränderung der Aminosäuresequenz oder der Sekundärstruktur der RNA, zu effizienten Triplets mutiert wurden. Um die Auswirkungen auf die Translations- und Replikationseffizienz im Vergleich zum Wildtyp zu erfassen, wurden die Replikons in Huh-7.5 Hepatomzellen transfiziert und zu definierten Zeitpunkten HiBiT-Translationsreporter-Assays durchgeführt. Die Translation der Genome wurde dabei als ein indirektes Maß für die Abundanz der Genome betrachtet. Die stille Mutation der ineffizienten zu effizienten Codons hatte in den Assays einen signifikanten negativen Einfluss auf die Replikation der Konstrukte, während die Translation nicht beeinträchtigt wurde. Das Pausieren der Ribosomen auf den ineffizienten Codons in der C-terminalen NS5B-Region scheint somit für die effiziente Initiation der HCV-Replikation durch die NS5B-Polymerase relevant zu sein, möglicherweise sogar als NS5B-Dimer. Dies könnte dadurch vermittelt werden, dass die schon gefaltete katalytische Domäne der NS5B-Polymerase durch das Pausieren genügend Zeit hat, cotranslational auf dem nahe gelegenen 3´-Ende des Genoms ihr Template für die Minusstrang-Synthese in cis zu binden.