Welcome to JLUpub
Recent Submissions
Item type:Item, Etablierung einer flüssigkeitschromatographisch- massenspektrometrischen Methode zur quantitativen Bestimmung von Cholinen und ihrer Metabolite(2025) Johne, Gabriela ElisabethDiese Arbeit befasst sich mit der Entwicklung und Etablierung einer HPLC-ESI- MS Methode zur Quantifizierung von Cholin und seinen Metabolite. Es wurde eine geeignete stationäre Phase ausgewählt in Kombination mit einer angepassten mobilen Phase. Diese ermöglichen eine effiziente Trennung der Analyte und eine empfindliche Detektion. Nach Methodenetablierung und Optimierung wurde die Methode validiert, um die Zuverlässigkeit und Genauigkeit der quantitativen Bestimmungen zu überprüfen. Die Validierungsdaten zeigen eine hohe Präzision und Sensitivität. Die Standardabweichung lag für alle Analyte unter 8 %. Die Wiederholbarkeit ist somit gegeben. Der Regressionskoeffzient über 0,99 zeigt eine hohe Linearität und damit die analytische Verlässlichkeit. Die Möglichkeit verschiedenste Cholinmetabolite nachzuweisen und zu quantifizieren, macht diese Methode zu einem vielversprechenden Werkzeug für die Analyse von PC-modifizierten parasitären Antigenen, die eine wichtige Rolle bei der Persistenz von verschiedensten Pathogen spielen. Dies sollte die Aufklärung der Biosynthese diese Antigene deutlich vereinfachen. Weitere Perspektiven liegen darin, den Cholinstoffwechsel in Bezug auf Lebererkrankungen, neurodegenerativen Erkrankungen und anderen relevanten Krankheiten weiter aufzuklären. Auch sollte eine Weiterentwicklung der Methode erwogen werden, um eine noch bessere Sensitivität und Spezifität insbesondere in biologischen Proben zu erreichen. Die Anwendung im Bereich der Lebensmittelchemie könnte neue Erkenntnisse über die Rolle von Cholin und seinen Metaboliten in verschieden Systemen liefern. Eine Analyse ermöglicht es cholinreiche Nahrung zu eruieren und somit Prozessysteme, Verdauungsmodelle und metabolische Wirkungssysteme im Menschen besser nachzuvollziehen. Zusammenfassend liefert diese Arbeit eine zuverlässige Methode zur Quantifizierung von Cholin und seiner Metabolite. Sie könnte eine Grundlage für künftige Forschungsvorhaben im Bereich der Untersuchung des Cholinstoffwechsels und seiner vielfältigen Bedeutung im Bereich physiologischer und pathologischer Veränderungen dienen.Item type:Item, „Sinnvoll aufgebaut, motivierend, hat Spaß gemacht und war praxisnah.“ Tut!-Evaluation „BALU“ Wintersemester 2025/26 Ergebnisse(2026-05) Kraatz, Carl EberhardDie Tutorien des Tutorienprogramms Tut! werden von den Teilnehmenden im Nachhinein in einer anonymen Evaluationsbefragung bewertet. Der Ergebnisbericht gibt Auskunft über die entsprechenden Einschätzungen. Die Ergebnisse sind Grundlage für die Weiterentwicklung des studentisch organisierten und selbstbestimmten Tutorienprogramms. Im Bericht werden die Ergebnisse aus der Befragung Wintersersemesters 2025/26 (N=57) dargestellt. Teilweise werden sie durch Daten aus der Tut!-Anmeldestatistik bzw. aus der Studierendenbefragung (JLU 2026) ergänzt/kontrastiert.Item type:Item, Genomic and quantitative genetic analyses of female fertility and calving traits in German Holstein cattle using alternative random regression modelling approaches(2025) Sakhaei Far, SinaThis thesis presents a comprehensive investigation of the genetic architecture of female fertility and calving traits in German Holstein cattle by integrating advanced quantitative genetic modeling and longitudinal genomic analyses. Due to their low heritability, strong environmental influence, and complex biological regulation, reproductive traits pose a long-standing challenge for dairy breeding programs. The work aims to improve the accuracy and biological relevance of genetic evaluations for traits such as non-return rate at 56 days (NRR56), calving-to-first service interval (CTFS), days open (DO), calving ease (CE), and stillbirth (SB). To achieve this, the thesis employs classical genetic models, random regression approaches, and longitudinal genome-wide association studies (GWAS), thereby combining statistical, genomic, and biological perspectives. Chapter 1 provides an extensive introduction to reproductive biology in dairy cattle and reviews key fertility and calving traits, along with their economic and welfare relevance. It discusses factors influencing reproductive performance, including management, behavior, health, and genetics, and outlines the limitations of traditional statistical methods that assume constant genetic effects across time. The chapter emphasizes the importance of longitudinal models and introduces the conceptual foundation of random regression models (RRM) and longitudinal GWAS. These approaches enable the modeling of heterogeneous variances across parities and capture time-dependent genetic effects. The chapter concludes by presenting the main objectives of the thesis: to estimate genetic parameters across reproductive traits using advanced modeling, to integrate genomic data into dynamic analyses, and to evaluate the biological function of identified genomic regions. Chapter 2 focuses on fertility traits and applies Multiple-trait models (MTM) and random regression models (RRM) to a large dataset comprising more than 592,000 fertility records. Genotypes from approximately 21,300 animals were integrated using a genomic relationship matrix. This chapter demonstrates that genetic variances and heritabilities for NRR56, CTFS, and DO generally increase with parity, particularly distinguishing heifers from cows. The RRM framework proved more biologically realistic, revealing parity-specific genetic patterns and declining genetic correlations as parity distance increased. Notably, correlations between heifer NRR56 and cow NRR56 were low (0.25-0.50), indicating distinct genetic expressions in early versus later reproductive cycles. The chapter shows that RRMs enable dynamic estimated breeding values (EBVs), which support more precise selection across the reproductive lifespan. Chapter 3 presents a longitudinal genome-wide association study (GWAS) for fertility traits, incorporating time-dependent single-nucleotide polymorphism (SNP) effects. Using repeated fertility measurements across six lactations, the study identifies significant genomic regions whose effects vary across reproductive stages. Circular Manhattan plots and quantile-quantile (QQ) plots illustrate both stage-specific SNP associations and overall model accuracy. Gene annotation and enrichment analysis reveal biological pathways relevant to reproduction, including hormonal regulation (for example, involving the gene CSMD1), cell adhesion (genes TMEM132C and DCHS2), and cell proliferation and oocyte (egg cell) development (gene CSNK1A1). Gene Ontology (GO) and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway analysis further highlight the contribution of signaling mechanisms such as Hippo, Wnt, and gonadotropin-releasing hormone (GnRH) to fertility regulation. These findings underscore the importance of incorporating temporal genetic variation in genomic evaluations and demonstrate the power of longitudinal GWAS for identifying biologically meaningful candidate genes. Chapter 4 investigates calving traits, specifically calving ease (CE) and stillbirth (SB), using three modelling approaches: a maternal model with direct and maternal genetic effects, a multiple-trait model (MTM) treating each parity (calving event per cow) as a distinct trait, and a random regression model (RRM), which describes calving performance across multiple parities. Using nearly half a million calving records, the chapter shows that incorporating maternal genetic effects substantially improves model fit and biological interpretation. The RRM approach again provides smoother variances across parities and realistic covariance structures. Moderate heritabilities and strong genetic correlations across parities highlight the potential for genetic improvement of calving traits. This chapter further demonstrates that modeling CE and SB at the dam (mother cow) level, rather than attributing them solely to the calf, better reflects underlying physiology and leads to more accurate estimated breeding values (EBVs). Chapter 5 synthesizes the results of all studies and discusses their implications for dairy breeding. Building on these findings, the thesis concludes that reproductive traits exhibit dynamic genetic architecture and cannot be fully captured by static models. Notably, random regression models consistently outperform conventional approaches in describing time-varying variances and correlations. Furthermore, longitudinal GWAS complements quantitative models by identifying functional genes and pathways involved at different reproductive stages. Collectively, this research provides a foundation for implementing longitudinal modeling in national breeding programs, enabling more accurate selection for fertility, calving performance, animal welfare, and overall herd sustainability.Item type:Item, Evaluation von Cystatin C und Neutrophilengelatinase-assoziiertes Lipocalin als diagnostische Biomarker beim akuten Nierenversagen bei Patienten mit Transkatheter-Aortenklappenimplantation(2024) John, EmanuelDie degenerative Aortenklappenstenose (AS) verläuft chronisch-progredient und ist bei älteren Patienten das Herzklappenvitium mit der höchsten Prävalenz. Für multimorbide Patienten ist der chirurgische Aortenklappenersatz mit einem hohen OP-Risiko verbunden. Die Transkatheter-Aortenklappenimplantation (TAVI) wurde primär für Patienten mit einem sehr hohem OP-Risiko entwickelt, konnte sich aber im letzten Jahrzehnt als Standardverfahren auch bei Patientin mit mittlerem OP-Risiko durchsetzen. Das akute Nierenversagen (ANV) ist eine der häufigsten Komplikationen nach einer TAVI. Dabei ist es nicht nur aufgrund seiner Häufigkeit von entscheidender Bedeutung. Vielmehr erhöht ein ANV nach TAVI das Mortalitätsrisiko massiv. Eine möglichst frühzeitige Identifizierung der Patienten, mit einem erhöhten Risiko für die Entwicklung eines ANV, ist deshalb von großer klinischer Bedeutung. Zur Beurteilung der Nierenfunktion findet, neben der Diuresemenge, momentan vor Allem das Serumkreatinin als Biomarker Anwendung. Aufgrund seiner Abhängigkeit von der Muskelmasse und seinem zunächst nur langsamen Anstieg im ANV, weist das Serumkreatinin jedoch auch einige Schwächen in seiner Funktion als Marker der Nierenfunktion auf. Ziel dieser Arbeit war es deshalb die Biomarker Cystatin C und NGAL als Marker der Nierenfunktion und bezüglich ihres prognostischen Wertes bei TAVI Patienten zu evaluieren. Hierzu wurden 483 TAVI-Patienten in die Studie eingeschlossen. Einziges Ausschlusskriterium war eine fehlende Einwilligung. Blutentnahmen erfolgten präoperativ zur Bestimmung der Baselinewerte sowie 4h, 24h, 48h und 72h postoperativ. Die Blutproben wurden umgehend verarbeitet und bei -80°C eingefroren. Die Klassifikation des ANV erfolgte gemäß den VARC-2-Kriterien. 110 Patienten (22,8%) entwickelten postoperativ ein ANV. 52 (47,3%) davon eine ANV Stadium I, 27 (24,5%) ein ANV Stadium II und 31 (28,2%) ein ANV Stadium III. Dabei zeigten sich signifikante maximale Konzentrationsunterschiede für Kreatinin, NGAL und Cystatin C zwischen der ANV-Gruppe und der Kontrollgruppe: Kreatinin 1.94 ± 0.67 mg/dL vs. 1.08 ± 0.24 mg/dL (p<0.0001), NGAL 129 ± 122 ng/mL vs. 52 ± 72 ng/mL (p<0.0001) und Cystatin C 0.58 ± 0.53 mg/L vs. 0.15 ± 0.39 mg/L (p<0.0001). Somit geben sowohl Cystatin C als auch NGAL die Dynamik eines ANV gut wieder. Dabei scheinen sich die Cystatin C Konzentrationsunterschiede besser zur Differenzierung zwischen den ANV Stadien zu eignen, da sich anhand ihrer auch ein ANV Stadium 3 abbilden lies. Das Risiko für die 30-Tages-Mortalität versiebenfachte sich durch ein ANV (OR 7,5; p<0,0001) und das Risiko für die 1-Jahres-Mortalität verdreifachte sich (HR 3,3; p<0,0001). Wir konnten somit aufzeigen, dass ein ANV nach TAVI das Mortalitätsrisiko massiv erhöht. Cystatin C und NGAL könnten eine wichtige Rolle bei der frühen Diagnose und der Verlaufskontrolle eines ANV spielen. Verglichen mit NGAL könnte sich Cystatin C dabei besser eignen, da sich auf Grundlage seiner Konzentrationsunterschiede die ANV Stadien besser abbilden lassen.Item type:Item, Funktionelle Untersuchungen zur Rolle von SOCS1-Mutationen bei der Entstehung des Hodgkin-Lymphoms(2025) Stecki, JuliaDie Pathogenese des Hodgkin-Lymphoms ist komplex und schließt mehrere Faktoren auf verschiedenen Ebenen ein. Dazu gehören unter anderem verschiedene somatische Mutationen und genetische Läsionen, welche Signalwege, wie den JAK/STAT Signalweg, betreffen. Mutationen, die den negativen Feedbackregulator SOCS1 betreffen kommen häufig vor und sind ebenfalls relevant in der Pathogenese des Hodgkin Lymphoms. Weitere Faktoren betreffen die Interaktion der HRS-Zellen mit der Mikroumgebung und die Abstammung dieser von Keimzentrums-B-Zellen. Bislang konnten viele pathogenetische Faktoren ermittelt werden, allerdings ist die Biologie des Hodgkin-Lymphoms noch nicht vollständig erschlossen. Bereits vorangegangene Arbeiten verweisen auf die pathogenetische Bedeutung des JAK/STAT-Signalweges und insbesondere der pathogenetischen Rolle von SOCS1 im Hodgkin-Lymphom. Ziel dieser Arbeit war es die funktionelle Rolle von wtSOCS1 und verschiedener SOCS1 Mutationsvarianten im Hodgkin-Lymphom und im Burkitt-Lymphom zu untersuchen. Hierfür wurden SOCS1-Überexpressions- und Knockoutexperimente in Hodgkin- und Burkitt-Zelllinienzellen durchgeführt. Die Ergebnisse zeigen, dass SOCS1 funktionell als Tumorsuppressor wirkt und die Toxizität durch SOCS1-Überexpression zum einen vom zellulären Kontext und zum anderem vom Mutationsstatus der Zelllinie abhängt. Nach Überexpression von SOCS1 und der Mutationsvarianten in der HL-Zelllinie L-1236, die eine biallelische SOCS1 Mutation besitzt, konnte ein toxischer Effekt, abhängig von der Mutationsvariante, beobachtet werden. In der HL-Zelllinie KM-H2, die keine SOCS1-Mutation aufweist, und in den Burkitt-Zelllinien konnten keine toxischen Effekte beobachtet werden. Zusätzlich weisen diese Beobachtungen darauf hin, dass sich die Zelllinie L-1236 womöglich als Modellsystem zur Detektion von deleterious-SOCS1-Mutationsvarianten eignet. Die Beobachtungen aus den SOCS1-Überexpressions- und Knockoutexperimente mit den BL-Zelllinienzellen deuten auf die fehlende Abhängigkeit von SOCS1 in der Pathogenese dieser Entität hin. Aufbauend auf diesen Beobachtungen könnten künftig weitere funktionelle Interaktionen und die Auswirkung von SOCS1 auf andere Signalwege und zelluläre Prozesse untersucht werden, um eine Grundlage für die Entwicklung neuer therapeutischer Ansätze im Hodgkin-Lymphom zu schaffen und womöglich SOCS1 als möglichen Biomarker in der Therapie einzusetzen.