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Liebe Nutzerinnen und Nutzer in der Zeit von Montag 22.04. 9:00Uhr bis voraussichtlich Mitwoch 24.04. 9:00Uhr ist JLUpub aufgrund von Wartungsarbeiten nicht erreichbar. Danke für Ihr Verständnis.
Dear users, JLUpub will be unavailable from Monday 22.04. 9:00 a.m. until probably Wednesday 24.04. 9:00 a.m. due to maintenance work. Thank you for your understanding.
Optimization of microarray technology-based expression profiling for investigation of different animal models of pulmonary hypertension
Differential gene expression can be investigated effectively by microarrays. Therefore, the respective technical steps and parameters, in particular RNA extraction, cDNA labelling, hybridization and washing for low-fluorescence background on slides have to be optimized. Comparing different RNA extraction techniques, we found that TrifastTM method followed by column purification combined with DNase digestion resulted in highest RNA quality of the samples.
Mikroarrays erlauben eine effektive Untersuchung differenzieller Genexpression. Zunächst müssen hierzu jedoch die entsprechenden technischen Schritte und Parameter, insbesondere die RNA Extraktion, die Markierung der cDNA, die Hybridisierung sowie Waschschritte zur Minimierung des Hintergrunds auf den Objektträgern optimiert werden. Beim Vergleich ... verschiedener RNA Extraktionsprotokolle fanden wir, dass die TrifastTM Methode mit anschließender Silicasäulenaufreinigung und kombiniertem DNase Verdau die höchste RNA Qualität ergab.